Костёл входит в состав монастырского комплекса реформатов, построенного в 1680-86 годах по проекту Яна Михала Линка. После ликвидации монастыря в ходе так называемых иосифовских реформ, его здание было разобрано, а костёл превращен в военный склад. Лишенное отделки здание в 1918 году было превращено в театр. В 1922 году здание было возвращено Церкви, а после ремонта в 1927 г. храм был переосвящён в честь св. Катажины. В первые три месяца войны в подземельях костёла хранилась картина Яна Матейко «Прусская присяга» усиленно и безуспешно разыскиваемый немцами. В последние годы костёл проходил капитальный ремонт, в ходе которого ему был возвращен исторический облик.
Внутри стоит обратить внимание на изображение покровительницы храма в стиле позднего барокко, первой половины XVIII века, перенесённое из деревянной церкви Святой Катажины на Любельском предместье.
Этот объект присутствует также в маршрутах осмотра с аудио записями